公司自2003年至2013年，承担的科研项目共22项。其中国防基础科研1项，国防技术基础科研3项，国防科技创新团队课题1项，高温气冷堆重大专项2项，大型先进压水堆重大专项4项，公司内部课题11项。其中国防基础科研项目《核工程抗强辐射屏蔽混凝土试验研究》，属于中国核工业建设集团公司第一个科研项目，其成果于2010年获得中国核能行业协会科技进步二等奖；包含国防技术基础科研项目《大体积混凝土测温研究》在内的“秦山核电二期扩建工程土建建造新技术的应用研究”成果正在申报中国核能行业协会科学技术奖。
由于公司在科研上的突出表现，2008年被国家国防科技工业局授予“国防科技创新团队”的荣誉称号。
